مخزن اسناد سازمان اوقاف و امور خیریه ازلحاظ امکانات و استانداردهای لازم مورد تائید سازمان اسناد و کتابخانه ملی ایران قرار گرفته است و با این سازمان به صورت مداوم تعامل و همکاری دارد.